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                    Southern blot
Southern blot
适配多类型样本
DNA定性或定量分析
验证基因重排/缺失/修饰
基因拷贝数差异分析
服务特色
1. 可直接对目标DNA片段进行定性与半定量分析,同时验证其分子量大小,结果直观可靠;
2. 适配多种样本类型(血液、组织、细胞、植物样本等),可检测基因组中特定基因序列的存在与否及拷贝数;
3. 可通过条带信号强度实现基因拷贝数或等位基因差异的量化,也能结合后续克隆实验验证基因结构;
4. 可与限制性片段长度多态性(RFLP)、DNA甲基化分析等技术联用,作为下游检测手段验证基因重排、缺失或修饰结果。
服务介绍
服务流程
客户提供
交付内容
服务说明
常见问题

服务介绍/Introduction

Southern Blot是一种常用的分子生物学技术,常用于检测特定DNA序列的存在、大小和相对丰度。

其原理为:在限制性内切酶作用下,genome DNA被切割成不同长度的片段,再经琼脂糖凝胶电泳按分子量大小分离。再通过电场作用,将DNA从凝胶迁移到NC膜上,进而通过探针杂交,实现对目标DNA片段的检测。

2.Southern blot.jpg

适用场景

 基因突变及重排检测:比较不同样品(如给药前vs给药后、病变vs正常)中目标DNA的缺失、插入或易位;

 表观遗传研究:联合甲基化敏感限制酶,分析DNA甲基化模式变化(如印迹基因或肿瘤抑制基因);

✪ 病原体检测:检测整合到宿主基因组中的病毒DNA(如HPV、HBV);

 克隆及图谱构建:分析基因组文库中特定片段,构建限制性酶切图谱;

 转基因生物鉴定:确认外源基因是否整合到宿主基因组及其拷贝数。


特色服务

✪ 提供定性与半定量分析;

✪ 适配多类型样本,如细胞、组织、血清等; 

✪ 提供灰度值量化,结果更加直观;

✪ 适合复杂组分验证。


服务流程/service process

服务流程图3.png


客户提供/Customer provides

样品信息

✪ 指标信息:含DNA名称、分子量大小等;

探针信息:≥10pmol/样(需明确序列、标记及使用比推荐);

注:若需我方提供探针,请明确目标基因序列、种属及标记要求。


送样要求

✪ 细胞:1×107个细胞,离心后收集细胞沉淀;干冰运输。

✪ 组织:动物组织不少于0.5 g;植物组织不少于1 g;干冰运输。

✪ 样品:已提取的高纯度genome DNA(OD260/280=1.8~2.0) ≥ 50 μg,浓度 ≥ 100 ng/L;干冰运输。

✪ 血液样品:≥  2 mL全血(含EDTA或肝素抗凝);干冰运输。


交付内容/Delivered content

✪ 全部原始胶图

✪ 灰度值分析图

✪ 检测实验报告


服务说明/Service Specification

southern blot.jpg

常见问题/Service Specification

Q: ELISA 实验标准曲线线性差、R² 值低该怎么排查?
A: 可从以下几方面逐一排查:①标准品配制,梯度稀释是否混匀;②孵育条件,温度、时间是否稳定;③洗涤步骤,是否充分去除残留;④底物显色,时间是否统一;⑤设备读数,酶标仪是否稳定。
Q: 多抗做 WB 时,条带总是有非特异性信号,该怎么优化?
A: 多抗检测容易出现非特异性背景干扰,可从多个实验环节进行优化改善:通过梯度稀释一抗筛选出最佳工作浓度,适当延长封闭时长并选用含 0.1% Tween-20 的封闭液,同时增加 TBST 洗涤次数以有效降低背景干扰;选用脱脂奶粉或 BSA 进行封闭时,需留意抗体适配性与交叉反应问题,尤其是磷酸化抗体应避免使用牛奶封闭,必要时可直接更换特异性更强的单克隆抗体,从根源减少非特异性杂信号。
Q: WB 条带中间出现白色圆圈(白圈),该怎么解决?
A: WB 条带出现白圈现象,大多是转膜过程中产生气泡所造成,主要是转膜组装三明治结构时胶与膜之间残留气泡,阻碍了蛋白正常转移,也可能是转膜温度过高滋生气泡或是膜活化不充分所致;实验组装时需用玻璃棒轻轻滚压彻底排尽气泡,同时采用预冷转膜缓冲液,并全程在冰浴条件下进行转膜操作即可避免该问题。
Q: WB 条带出现 “微笑 / 皱眉” 形状,是什么问题?
A: WB 条带出现变形多与电泳操作环节密切相关,主要原因包括凝胶配制时聚合不均匀或内部残留气泡、电泳电压过高使凝胶发热造成蛋白迁移不均,以及上样量过大或样本盐浓度偏高干扰正常迁移速率;实际实验中可通过降低电泳运行电压、保证凝胶充分完全聚合、优化样本缓冲液配比等方式,有效改善条带变形的问题。
Q: WB 条带位置和预期分子量不符,该怎么排查?
A: 条带位置偏差的常见原因:① 蛋白存在翻译后修饰(如糖基化、磷酸化),会导致分子量偏移;② 存在转录异构体或蛋白剪切产物;③ 凝胶浓度选择不当(如小分子蛋白用高浓度胶);④ 电泳条件不稳定,导致迁移率异常。可结合文献和阳性对照验证条带特异性。
Q: WB 条带出现很多杂带,是什么原因?
A: WB 实验中条带出现杂带的主要成因包括:一抗特异性较差,存在非特异性结合;一抗或二抗浓度过高,导致非特异性信号增强;封闭不彻底,膜上的非特异性位点未被有效封闭;样本中蛋白发生降解或存在非特异性杂蛋白干扰;以及电泳时上样量过大,超出了抗体的识别能力。针对这些问题,可通过梯度稀释抗体找到最佳工作浓度、优化封闭条件以减少非特异性结合、增加样本纯化步骤来去除杂质,从而有效改善杂带问题。
Q: WB 背景很高、整片发黑,该怎么解决?
A: WB 实验中背景信号过高通常与封闭、抗体孵育及洗涤环节相关:首先要排查封闭是否充分,可通过延长封闭时间(如延长至 2 小时)或更换封闭液改善,例如使用 BSA 替代脱脂奶粉,避免内源性磷酸酶对磷酸化抗体检测的干扰;其次可能是抗体浓度过高,可适当降低一抗与二抗的稀释比例,减少非特异性结合;此外洗涤不充分也会导致背景升高,建议增加 TBST 的洗涤次数并延长每次洗涤的时间;最后还需注意实验操作的规范性,避免用手直接接触膜,使用干净的耗材,防止膜被污染而造成背景异常。
Q: WB 条带信号很弱,如何增强信号?
A: 可以从以下环节优化: ① 增加蛋白上样量(确认样本无降解); ② 降低一抗稀释比例,延长 4℃孵育时间; ③ 优化转膜条件,确保蛋白高效转移; ④ 使用灵敏度更高的发光试剂; ⑤ 调整曝光时间,或改用荧光 WB 系统提升检测限。
Q: WB 实验中完全没有条带信号,可能是什么原因?
A: 常见原因包括: ① 目的蛋白在样本中表达极低或不表达; ② 蛋白降解(未加足量蛋白酶抑制剂、反复冻融); ③ 转膜失败(蛋白未转移到膜上或转过凝胶); ④ 一抗 / 二抗不匹配、浓度过低或孵育时间不足; ⑤ 曝光时间过短或检测系统灵敏度不足。可通过加入阳性对照、优化转膜条件和抗体浓度排查。
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