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                    RNA纯化法染色质分离(ChIRP-qPCR/MS/Seq)
RNA纯化法染色质分离(ChIRP-qPCR/MS/Seq)
检测调节RNA结合调控的DNA和蛋白质
RNA-DNA互作研究
RNA-蛋白质互作研究
高通量检测
服务特色
ChIRP是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白的高通量检测方法。
服务介绍
服务流程
客户提供
交付内容
服务说明
常见问题

服务介绍/Introduction 

RNA纯化的染色质分离技术(Chromatin Isolation by RNA Purification,ChIRP)是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白的高通量检测方法。

其方法是通过设计生物素标记RNA互补探针,其与链霉亲和素结合,将目标RNA特异性结合的同时,特异性捕获RNA结合调控的DNA染色体片段及参与转录调控的RNA结合蛋白质(RBPs)。

①DNA染色体片段经过构建文库及高通量测序,可以基因组水平获得转录调控RNA(增强子RNA,eRNA)转录调控的下游靶基因,结合qPCR可以研究结合调控强度;

②RNA结合蛋白经过酶消化及高效液相-质谱分析,可以鉴定参与转录调控的蛋白质,结合western blot可以进一步研究结合作用强度。

ChIRP.jpg

 适用场景

✪  基础机制研究:定位RNA-染色质直接互作、解析三维基因组结构;

✪  互作网络解析:RNA-蛋白质相互作用(ChIRP-MS)、RNA-RNA相互作用、功能协同分析;

✪  疾病与病毒研究:癌症表观遗传重编程、病毒-宿主互作、神经发育与病理。

 

 特色服务 

 ✪ 全流程服务:服务涵盖全流程实验,高效完整; 

 ✪ 个性化方案:根据实验目的提供专属实验方案及解决方案; 

 ✪ 完整数据链:详实的试验记录、完整的原始数据及详细的技术检测报告,为您的科研保驾护航; 

 ✪ 超长的售后:1年超长售后,含样本保存及疑问解答等。

服务流程/service process

服务流程图3.png

客户提供/Customer provides

样本信息

✪  靶标信息:DNA/RNA/蛋白名称+物种/登录号/序列;

✪  抗体信息:IP级抗体≥10 μL/样,需明确物种信息、稀释比等;

✪  探针:≥1 pmol/样


送样要求

  组织:动物组织≥0.5 g;植物组织≥2 g;新鲜取材,干冰运输;

✪  细胞:≥ 1×107/样;离⼼后收细胞沉淀,沉淀体积约为80-100 μL;干冰运输;复苏细胞常温运输;

✪  探针:≥1 pmol/样;干冰运输。

注:特殊条件及样品请详询。

交付内容/Delivered content

✪  所有原始数据;

✪  检测实验报告。

注:以上均为常规提供,特殊要求请详询。

服务说明/Service Specification

CHIRP.png

常见问题/Service Specification

Q: 分子互作结果无法重复、时有时无,怎么破?
A: 分子互作实验结果难以重复、信号时有时无,核心原因在于细胞批次与代数差异、实验操作未标准化、样本状态不稳定以及弱相互作用易受环境条件波动影响;可通过统一使用同一批次、相同代数的细胞,严格在 4℃、14000 g 条件下裂解 15 min,把控孵育时长并保持全程持续旋转,磁珠提前预洗两次,选用同一批号抗体,关键实验至少设置三次生物学重复与技术重复,以此实现实验流程标准化,保证结果稳定可重复。
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