服务介绍/Introduction
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是美国Stanford大学的William Greenleaf教授在2013年所研发的一种实验方法,是一种利用高通量测序对转座酶易接近核染色质进行分析的方法。通过高活性的 Tn5 转座酶将测序接头插入染色质的开放区域,然后通过测序数据来推断染色质区域的可及性,并计算转录因子结合位点和核小体的区域位置。
ATAC-seq通过绘制全基因组染色质可及性图谱,揭示细胞类型特异的表观遗传调控机制,目前已广泛应用于发育生物学、疾病研究(如癌症异质性)和药物靶点筛选等领域。

适用场景
✪ 表观遗传学;
✪ 疾病研究;
✪ 发育生物学等领域;
✪ 染色质可及性和基因调控机制研究。
特色服务
✪ 全流程服务:服务涵盖全流程实验,高效完整;
✪ 个性化方案:根据实验目的提供专属实验方案及解决方案;
✪ 完整数据链:详实的试验记录、完整的原始数据及详细的技术检测报告,为您的科研保驾护航;
✪ 超长的售后:1年超长售后,含样本保存及疑问解答等。
服务流程/service process

客户提供/Customer provides
送样要求
✪ 组织:动物组织≥1 g;植物组织≥1 g;新鲜取材,干冰运输;
✪ 细胞:≥ 1×106/样;干冰运输。
注:特殊条件及样品请详询。
交付内容/Delivered content
✪ 数据基本处理与质控;
✪ 文库插入片段长度分布;
✪ 基因组测序深度累积分布;
✪ 各样品基因promoter(up2K)区测序深度分布;
✪ Peak检测;
✪ Peak长度分布;
✪ Peak深度分布;
✪ 样本生物学重复 IDR 分析;
✪ Peak在基因功能元件上的分布;
✪ Peak相关基因;
✪ Peak相关基因的GO功能显著性富集分析;
✪ Peak相关基因的pathway富集分析;
✪ 样本间差异peak检测;
✪ 样品间差异peak在基因功能元件的分布;
✪ 样品间差异peak相关基因;
✪ 样品间差异peak相关基因的GO和KEGG富集分析;
✪ 所有原始数据;
✪ 检测实验报告。
注:以上均为常规提供,特殊要求请详询。
服务说明/Service Specification

常见问题/Service Specification