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                    ATAC-Seq
ATAC-Seq
高灵敏
高分辨
应用广泛
多维度分析
服务特色
ATAC-seq是一种基因组技术,通过转座酶标记可及的染色质区域并进行测序,用于研究基因表达调控和染色质可及性。该技术无需抗体或复杂交联步骤,显著节省时间成本,而且可精准定位开放染色质区域(分辨率达单碱基水平),识别转录因子结合位点及核小体排布,适用于微量样本(低至500~50,000个细胞),尤其适合珍贵临床样本或单细胞分析。
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客户提供
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服务说明
常见问题

服务介绍/Introduction 

ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是美国Stanford大学的William Greenleaf教授在2013年所研发的一种实验方法,是一种利用高通量测序对转座酶易接近核染色质进行分析的方法。通过高活性的 Tn5 转座酶将测序接头插入染色质的开放区域,然后通过测序数据来推断染色质区域的可及性,并计算转录因子结合位点和核小体的区域位置。

ATAC-seq通过绘制全基因组染色质可及性图谱,揭示细胞类型特异的表观遗传调控机制,目前已广泛应用于发育生物学、疾病研究(如癌症异质性)和药物靶点筛选等领域。

08.ATAC-Seq.jpg

 适用场景

✪ 表观遗传学;

✪ 疾病研究;

✪ 发育生物学等领域;

✪ 染色质可及性和基因调控机制研究。

 

 特色服务 

 ✪ 全流程服务:服务涵盖全流程实验,高效完整; 

 ✪ 个性化方案:根据实验目的提供专属实验方案及解决方案; 

 ✪ 完整数据链:详实的试验记录、完整的原始数据及详细的技术检测报告,为您的科研保驾护航; 

 ✪ 超长的售后:1年超长售后,含样本保存及疑问解答等。

服务流程/service process

服务流程图3.png

客户提供/Customer provides

送样要求

  组织:动物组织≥1 g;植物组织≥1 g;新鲜取材,干冰运输;

✪  细胞:≥ 1×106/样;干冰运输。

注:特殊条件及样品请详询。

交付内容/Delivered content

✪  数据基本处理与质控;

✪  文库插入片段长度分布;

✪  基因组测序深度累积分布;

✪  各样品基因promoter(up2K)区测序深度分布;

✪  Peak检测;

✪  Peak长度分布;

✪  Peak深度分布;

✪  样本生物学重复 IDR 分析;

✪  Peak在基因功能元件上的分布;

✪  Peak相关基因;

✪  Peak相关基因的GO功能显著性富集分析;

✪  Peak相关基因的pathway富集分析;

✪  样本间差异peak检测;

✪  样品间差异peak在基因功能元件的分布;

✪  样品间差异peak相关基因;

✪  样品间差异peak相关基因的GO和KEGG富集分析;

✪  所有原始数据;

✪  检测实验报告。

注:以上均为常规提供,特殊要求请详询。

服务说明/Service Specification

ATAC.png

常见问题/Service Specification

Q: ELISA 实验标准曲线线性差、R² 值低该怎么排查?
A: 可从以下几方面逐一排查:①标准品配制,梯度稀释是否混匀;②孵育条件,温度、时间是否稳定;③洗涤步骤,是否充分去除残留;④底物显色,时间是否统一;⑤设备读数,酶标仪是否稳定。
Q: 表观遗传实验中 DNA 容易降解,该如何全程防控?
A: 表观遗传各类实验中 DNA 易发生降解,主要受核酸酶污染、反复冻融、室温放置时间过长及试剂耗材不达标影响,实验全程需采用无酶离心管与枪头,全程低温冰上操作,样本分装保存避免反复冻融,操作流程紧凑缩短室温暴露时间,配制缓冲液添加核酸酶抑制剂,从样本处理到反应全程严格防控 DNA 降解。
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